v2 WTパネル遺伝子発現
Visium HDテクノロジーを活用することで、シングルセルスケールの解像度で隙間のない組織解析を実現
第一世代スライドデザインは1~10細胞解像度を提供
v2遺伝子発現を選択する理由
がん免疫にフォーカスしたタンパク質パネルによるマルチオミックスなオプション
11 mm x 11 mm のキャプチャーエリアにより、大きなサイズの組織にも対応
アッセイ仕様
マウス
ヒト
生物種
FFPE組織
新鮮凍結組織
固定凍結組織
対応サンプル
プローブベースの遺伝子発現
タンパク質
形態学的解析
ヒトがん免疫タンパク質パネル
マルチオミックス
対応装置
スループット

キャプチャーサイズ: 6.5 x 6.5 mm

キャプチャーサイズ: 11 x 11 mm
アッセイ構成要素
Consumables
Index Kit
1000251
Dual Index Kit TS Set A, 96 rxn
Core Slides and Reagents
1000520
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Human Transcriptome, 6.5mm, 4 rxns
1000443
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Human Transcriptome, 6.5mm, 16 rxns
1000522
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Human Transcriptome, 11mm, 2 rxns
1000444
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Human Transcriptome, 11mm, 8 rxns
1000521
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Mouse Transcriptome, 6.5mm, 4 rxns
1000445
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Mouse Transcriptome, 6.5mm, 16 rxns
1000523
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Mouse Transcriptome, 11mm, 2 rxns
1000446
Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE, Mouse Transcriptome, 11mm, 8 rxns
Starter Kits and Accessories
1000469
Visium 6.5mm Slide Cassette, 4 pk
1000470
Visium 11mm Slide Cassette, 4 pk
1000471
Visium CytAssist Tissue Slide Cassette, 4 pk, 6.5 mm
1000472
Visium CytAssist Tissue Slide Cassette, 4 pk, 11 mm
RNase Inhibitor (Optional)
1000887
Kit, RNase Inhibitor 40x

製品資料
ユーザーガイド
サンプル調製
シーケンス要件
最終的な遺伝子発現ライブラリーは、組織で覆われたキャプチャースポット1ヵ所に対して2万5千リードペアの推奨最小深度でシーケンスされます。最終的なタンパク質発現ライブラリーは、組織で覆われたキャプチャースポットに対して5千リードペアの推奨深度でシーケンスされます。
データ解析

Space Ranger 解析パイプライン
入力ファイルタイプを処理し、Visiumシーケンスデータを組織画像に合わせて調整します。オプションの細胞セグメンテーションを実施する無償の解析パイプライン
